武宗灭佛的原因，我想已经不必多说了。此处只说三夷教的问题。
首先，题主这个题目描述是有问题的。会昌法难是否波及了回、景、祆三教？答案显然是否定的，这里并没有回教什么事。所谓「三夷教」，指的是摩尼教、景教（基督教聂斯托利派）和祆教（琐罗亚斯德教）。这三教在会昌法难中待遇各有不同，此处就不多说了。
那么，唐代是否有回教在中国流传呢？虽然唐代伊斯兰教可能已经传入中国，但只限于个别海外人士，个人信奉。不存在大规模的宗教活动，也不存在政府的支持，几乎可以忽略。「隶僧尼属主客，显明外国之教；勒大秦穆护祆三千余人还俗，不杂中华之风」。有人把此处的「穆护」解释成穆斯林，我认为这是极为扯淡的。唐代对寺庙管理极严格，修建寺庙必有备案。史书中摩尼教的大云光明寺、景教的大秦寺和祆教的祆祠都有明文记载，但从未见过伊斯兰教清真寺的记录。无论文献或是考古实证，都未发现回教在唐代传播的证据。《通典》大食传中言：「有礼堂，容数万人。每七日，王出礼拜，登高座，为众说法曰：人生甚难，天道不易。奸非劫窃，细行谩言，安己危人，欺贫虐贱，有一于此，罪莫大焉。凡有征战，为敌所戮，必得生天。杀其敌人，获福无量。……胡则一种，法有数般，有大食法，有大秦法。其大食法者，不食猪狗驴马等肉，不拜国王父母之尊，不信鬼神，祀天而已。其俗每七日一假，不买卖，不出纳。」若是唐代伊斯兰教在中国有传播，断然不会在此处只字未提。
伊斯兰教既然在唐代并无流传，何以出现此等说法？何乔远《方域志》中说「自郡东，南折而东，遵湖往南行为灵山。有默德那国二人葬焉，回回之祖也。回回家言，默德那国有吗喊叭德圣人，生隋开皇元年，圣真显美，其国王聘之。御位二十年，降之经典，好善恶恶，奉天传教，日不晒曝，雨不湿衣，入火不死，入水不澌，呼树而至，法回而行，门徒有大贤四人，唐武德中来朝，遂传教中国，一贤传教广州，二贤传教扬州，三贤四贤传教泉州，卒葬此山。」注意「回回家言」。穆斯林把自己的宗教强行扯到唐朝，证明其历史地位，不是一天两天了。西安礼拜寺称自己为天宝年间所造，实为明代造物。广州怀圣塔亦称自己始于唐时，实为北宋所造。甚至20世纪初，摩尼教敦煌文书发现之前，也有人将史书中记载的「摩尼」扯成「穆斯林」。总而言之，若回教在唐代广为流传，乃至为会昌法难所打击，则其遗迹、史料必不可少。若毫无证据，则必然是穆斯林为了显得自己历史悠久，教法高深而牵强附会。
另一点，若是伊斯兰教流传于唐代，则「三夷教」必然要变为四夷教。唐代史料记载伊斯兰教时，往往表现出其善于争战，武力征服的特点。「其俗勇于战斗」。伊斯兰教，是一种顽固的宗教，不愿意改变自己的特点以适应当地民族，而是采取战争的方式强行使被征服民族伊斯兰化。正因如此，景教、祆教和摩尼教都采用和平方式，成功进入中国，而穆斯林面对唐朝，既不能用武力征服，又不愿放下身段迎合中国人，因此在唐朝的传教工作几乎等于零。所谓会昌法难波及回教，当然也属无稽之谈了。
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然后再细说三夷教的问题。虽然会昌法难的主体是佛教，三夷教是被牵连的一方，但具体到每个宗教，仍然需要具体分析。我们知道三夷教虽然势力远不如佛道两教兴盛，所以被统称三夷教，然而其内部势力仍有差别。摩尼教，是三夷教中最为强盛的一方，景教祆教则居其次。造成这种实力对比的原因，倒不是因为摩尼教教义有什么独到之处，因此获得广泛信仰，而是因为摩尼教的主场在回鹘。每一个宗教的发展，都离不开世俗势力的支持；祆教的主场在波斯，景教的主场也在波斯、叙利亚一带。这两个宗教的中心西亚地区，离唐朝的势力范围实在太远，因此对于唐朝的影响，多是宗教的、文化的影响而非政治上的。摩尼教则不然；唯一一个明确支持摩尼教、把摩尼教奉为国教的国家回鹘，就在唐朝旁边。此时摩尼教似乎重演了当年在罗马帝国传教时遇到的困境，即传教的对象是敌国，敌国统治者天然会对这种宗教产生排斥心理——不过此时有所不同，唐朝和回鹘的关系不能用单纯的敌国来形容。唐朝和回鹘关系时好时坏，好时就放任摩尼教稍微传一传，坏时就出重手打击摩尼教。
840年，回鹘为黠戛斯所灭；842年，废天下摩尼寺；843年，尽杀天下摩尼僧。唐朝对待摩尼教的态度，在此时已经表露无遗；摩尼教一旦失去了支持它的回鹘势力，则立刻为唐朝所灭。正是成也回鹘，败也回鹘。靠着回鹘的政治压力，摩尼教在中国各地都置有摩尼寺，虽势力比起佛道大有不如，与景教、祆教相比却又不知道高到哪里去了。一旦回鹘灭亡，摩尼教也随之被灭。唐代对待三夷教的态度各有不同：「会昌三年四月，武宗以回纥破灭，诏天下摩尼寺皆废除，其寺院庄宅、钱物等，委功德使、御史台及京兆府差官吏点检没收。摩尼僧徒配流诸道，死者大半，京城女摩尼僧死七十二人。」「四月中旬，下，令杀天下摩尼师。剃发，令袈裟，作沙门形而杀之。摩尼师即回鹘所崇重也。」唐朝对摩尼教的态度很明确：一杀了事。一方面因回鹘破灭，正好对一直以来看不顺眼的摩尼教动手；另一方面，灭佛运动正搞得热火朝天，不如顺手把摩尼教一起灭掉。虽然摩尼教不是佛教，但谁让你「妄称佛教，诳惑黎元」，我就干脆把你打扮成和尚，一起弄死好了。
那么，面对另外两种堪称人畜无害的宗教，唐朝又是何种态度呢？祆教史料较少，可以确定是信徒大部分是外国人，在中国传播并不广泛；景教倒是积极传教，但效果也很一般。二者在宗教方面极其无害，又无力影响唐朝的政治，此次灭佛被波及，纯属点背。既然无力影响唐朝政治，那唐朝顺手把二者灭掉，也不会引起什么大麻烦。若是三夷教中只灭一教，从此变成两夷教，感觉实在有点别扭。佛教本是外邦宗教，传至中国引发这一堆乱子。若保留这两个宗教不灭，难保它们不会成为下一个佛教。唐朝方面给出这样的解释：「隶僧尼属主客，显明外国之教；勒大秦穆护祆三千余人还俗，不杂中华之风。」就是说，你本身没什么大错，但你作为一种外国宗教，这是你天生自带的原罪。留你在这，怕是会影响我中华的风气，以夷变夏。所以我把你赶走，但是我不杀你。你自己自生自灭去吧，不要在我中国传教。
总而言之，会昌法难中，摩尼教算是恰逢其会，无所谓无辜波及，实在是时也命也，谁让回鹘正好在这时灭国呢，唐朝早就想对摩尼教下刀了。景教和祆教倒是一脸无辜。至于伊斯兰教，这里实在没他们什么卵事啊。
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