佟佳氏有两支来源，一支来源于满人，本姓夹谷氏，迁于佟佳江，故以地为氏。另一支来源于汉人，佟姓汉人加入满族者，在汉姓之后皆加“佳”字，从满语发音习俗之故。如爱新觉罗之金启孮所著《八旗子弟》：
佟佳江即佟家江，今名浑江，是鸭绿江的一条支流，"本名卒本川或婆猪江，因佟姓迁居于此，故改称佟家(佳)江。"（参见《满族佟氏史略序》）。类似的还有石城乡的“佟家窝棚”，叆阳乡的“佟家堡”、大洼乡的“佟家村”等。
康熙的生母佟佳氏，即属于后者，其家族本是辽东汉人豪族，世代为官。
如佟登，"癸丑进士，节制三藩，进秩一品，身系安危如郭子仪者三十余年。"，做到中军都督府都督同知，荣禄大夫。
如佟卜年，万历丙辰进士，历任山东监军道，河间县知县，四川夔州府同知等职。
不过，到了明末，佟氏中的部分成员像佟养性佟养真投靠了后金，致使家族沦为“逆族”，清代佟世思在追念家世时，痛惜道：
直到康熙登基第二十七个年头，康熙的舅父佟国纲，突然上了一道奏折《为敬陈微臣原系满洲仰祈睿鉴事》，声称其家族本是满人。
当然，“贸易边境，诱入开原”的故事在明代史料中，全无记载。而通过修改族属，抬高身份的行为，在历史上倒是很常见。如北朝独孤氏，自称汉朝度辽将军刘进伯之后，因出征匈奴失败，被匈奴人囚在孤山。
努尔哈赤所谓“知之久矣”，不过是为了拉拢佟养性而已，为了进一步拉拢，佟养性还和另一汉人降将李永芳一起做了努尔哈赤的孙女婿。努尔哈赤从来不相信也不认为佟养性是满人出身。
对佟养性知根知底的明朝：
不过因为佟家是康熙的母家，之后清修的《八旗满洲氏族通谱》《皇朝通志》等等史料，基本都采用了所谓“原本满洲、近边贸易、诱入开原”的说辞，佟家的清修的族谱更不用说。并和满人佟佳氏联了宗谱（明代族谱中，因前世邈不可考，以明初佟达礼为一世祖。清修时，于其上又加一世，名巴虎忒克申，从而与满人佟佳氏联宗）。但私下仍延续明代的习惯，以北燕佟万佟寿为远祖。
