以新正史来谈谈这个问题吧。
在EP2结尾，Anakin和Padme在Naboo举行了婚礼。虽然这婚礼是秘密进行的，但是确实是合法的婚礼。也就是说他们是合法的夫妇。
在The Clone Wars第7季第2集中，可以看到全息影像中的Padme腹部隆起，这就是明示她怀孕了。
在EP3中，66号令之后，Obi-Wan造访Padme的公寓，问Padme她腹中的孩子是不是Anakin的。Padme没有说话，但行为举止给出了肯定的回答。
综上几条信息，我们可以认为Padme怀的是Anakin的孩子，孕期是克隆人战争最后的岁月，也是旧共和国最后的岁月。
